故事的開(kāi)頭如同《迷失》一樣，始于一架即將出事的飛機(jī)。在迫降之后飛機(jī)上所有人都死于一種神秘的病毒，F(xiàn)BI以及各方調(diào)查組介入調(diào)查。但這只是故事的開(kāi)始，接下來(lái)FBI的女特工奧利弗-鄧哈姆（Olivia Dunham）和高智商天才彼得-畢舍普（Peter Bishop）將攜手面對(duì)一系列匪夷所思的可怕現(xiàn)象。為了阻止危機(jī)的進(jìn)一步擴(kuò)展，他們將尋求彼得早已疏遠(yuǎn)的父親的幫助。而他的父親沃特-畢舍普博士（Dr。 Walter Bishop）則一直被精神病院所收留。出院之后，三個(gè)人組成的調(diào)查小組開(kāi)始對(duì)各種離奇事件進(jìn)行研究。　　隨著遇到的事情越來(lái)越棘手，沃特-畢舍普博士背后不為人知的一面也逐漸浮出水面。片中出現(xiàn)的一個(gè)名為巨能（Massive Dynamic）的前沿科技公司也跟沃特-畢舍普博士頗有淵源，提供它的創(chuàng)始人曾跟他同在一個(gè)實(shí)驗(yàn)室共事。但巨能公司的詭秘行為卻不得不讓人懷疑它跟一系列神秘事件脫不開(kāi)關(guān)系，不過(guò)偶爾也會(huì)為奧利弗等人提供一些幫助，這讓它的真正目的變得更加撲朔迷離。到底巨能公司是為了拯救人類不遺余力的正義天使還是妄圖將整個(gè)地球變?yōu)樽约嚎梢詾樗麨榈膶?shí)驗(yàn)室的幕后黑手？隨著奧利弗等人的深入調(diào)查，真相將逐漸水落石出。